Технології 3 хв читання Автор: Єва Семенюк
ШІ GenoMorph виявив 2351 генетичний перемикач для відтворення додо
Компанія Colossal Biosciences застосувала систему штучного інтелекту GenoMorph для пошуку регуляторних ділянок ДНК, що відповідають за форму черепа та дзьоба вимерлого птаха додо. Алгоритм ідентифікував 2351 елемент, які тепер перевірятимуть у лабораторії на нікобарських голубах.
Американська біотехнологічна компанія Colossal Biosciences повідомила про проміжний результат у проєкті відтворення вимерлого птаха додо. Дослідники використали спеціалізовану систему штучного інтелекту GenoMorph, яка проаналізувала регуляторні ділянки ДНК і визначила 2351 елемент, безпосередньо пов’язаний із формуванням специфічної структури черепа та дзьоба цього виду. Ці елементи функціонують як біологічні перемикачі, що задають послідовність та інтенсивність активності генів під час ембріонального розвитку.
Методологія дослідження спиралася на створення атласу регуляторної активності птахів. Науковці опрацювали сотні зразків тканин курей, перепелів, качок і голубів, зафіксованих на різних етапах внутрішньоутробного росту. Ці дані об’єднали з результатами сканування та аналізу геномів понад 70 сучасних видів птахів, включно з нікобарським голубом, який є найближчим біологічним родичем додо серед нинішніх видів.
У межах цього набору даних штучний інтелект визначив 653 потенційні генетичні регулятори, що впливають на розмір дзьоба, та ще 1698 елементів, які контролюють його ширину й товщину. Отриманий масив інформації слугує картою для подальших експериментів. Водночас дослідники наголошують: наявність цих регуляторних послідовностей наразі не є доказом того, що саме вони відповідають за конкретні анатомічні ознаки додо. Список визначено як кандидатів для лабораторного тестування.
Наступним кроком стане перевірка функціональності цих ділянок ДНК та спроба їх інтеграції в ембріони птахів. Такий підхід вимагає надзвичайної точності, оскільки регуляторна ДНК визначає не просто наявність білків, а складний часовий графік їхньої появи, що критично впливає на розвиток морфології організму в цілому. Успішне редагування окремих генів не гарантує відтворення фенотипу вимерлої тварини.
Для практичної реалізації планів компанія розширила власну колонію нікобарських голубів у штаті Техас, де нині утримується 36 особин. Окрім генетичного моделювання, розробники впровадили нову систему доставки інструментів редагування генів, таких як технологія CRISPR, безпосередньо в пташині ембріони. Це технічне рішення має забезпечити можливість внесення цільових змін у геном.
Колектив дослідників зазначає, що створення повноцінного живого організму потребує вирішення як біологічних, так і обчислювальних завдань, які залишаються головним бар’єром на шляху до відновлення видів. Реконструкція зовнішності додо — лише один з етапів проєкту, що передбачає складне втручання в біологічні системи. Хоча розробники декларують створення технологічної бази для подібних процесів, реальне повернення додо залишається гіпотетичним сценарієм. Надалі фахівці планують провести серію експериментальних випробувань, щоб підтвердити, чи здатні ідентифіковані генетичні перемикачі формувати ознаки, притаманні представникам роду Raphus.
11
